1995年台湾开始正式实施全民健康保险制度，民众在按规定缴纳保险费后便可在医疗机构免费接受医疗服务（部分需自费），由健保局向医疗机构支付费用。http://www.hibor.com.cn【慧博投研资讯】后因支付压力增加，便引入总额支付制度，根据上一年的医疗服务量，对每家医疗机构下一年的支付额度进行预算。http://www.hibor.com.cn（慧博投研资讯）因此医疗机构每年的健保收入固定（另外部分收入来自非健保项目），超额负担、结余转盈，成本控制成为决定医院利润的关键因素。
　　此种制度下，药品采购是医院的成本项。健保局就目录内药品，与每一家药企谈判其支付价格（因此不同厂家的同一仿制药支付价格不同），同时允许医疗机构在采购时与药企议价，差价便结转为医院的利润。但如果该差价超过30%，健保局便会进一步下调支付价格（因此台湾仿制药的价格呈现逐渐下降的趋势）。
　　这导致台湾的仿制药价格竞争异常激烈，药企依靠规模效应和成本优势取胜，行业集中度很高。
　　由于全民健康保险制度下，民众免费接受医疗服务，在用
　　药选择上进口原研药成为首选。因此台湾药品消费市场原研药占据大部分市场份额，仿制药市场占比仅在20%左右。台湾仿制药市场规模较小，每年约300亿新台币。
　　我们分析，台湾用药市场原研药占比较高、而仿制药市场占比较低（这与大陆截然相反）的原因有以下几点：台湾全民健保体系将大多数原研药纳入健保给付范围内，因此原研药在台湾的临床使用较为广泛；特别是全球新上市专利药进入台湾市场速度较快，在健保支持下在临床的使用推广相对容易；
　　原研专利过期后，医疗机构通常采购“原研&1-2种仿制药”供使用，医生处方时会充分考虑仿制药的安全有效性，仿制药对原研药的替代需要时间和过程；
　　随着健保支付价格不断下降（包括原研和仿制药），节约的健保资金又不断纳入新上市的专利药以满足临床需求，因此新专利药的更新较快；
　　部分患者愿意自付差价使用原研药，也是一个重要因素。